Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK1EP49674 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms