Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC34P49427 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC34P49427 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC34P49427 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC34P49427 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC34P49427 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC34P49427 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC34P49427 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC34P49427 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC34P49427 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC34P49427 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC34P49427 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC34P49427 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC34P49427 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC34P49427 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC34P49427 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC34P49427 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC34P49427 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC34P49427 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC34P49427 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC34P49427 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC34P49427 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC34P49427 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC34P49427 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC34P49427 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC34P49427 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC34P49427 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC34P49427 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC34P49427 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms