Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGM4P49221 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGM4P49221 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGM4P49221 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGM4P49221 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGM4P49221 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGM4P49221 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM4P49221 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM4P49221 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM4P49221 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM4P49221 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM4P49221 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM4P49221 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM4P49221 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM4P49221 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM4P49221 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM4P49221 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM4P49221 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM4P49221 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM4P49221 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM4P49221 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM4P49221 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM4P49221 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM4P49221 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM4P49221 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM4P49221 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM4P49221 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM4P49221 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM4P49221 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM4P49221 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM4P49221 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM4P49221 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM4P49221 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM4P49221 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM4P49221 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms