Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms