Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSSP48449 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSSP48449 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSSP48449 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSSP48449 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSSP48449 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSSP48449 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSSP48449 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSSP48449 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSSP48449 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSSP48449 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LSSP48449 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LSSP48449 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LSSP48449 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSSP48449 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSSP48449 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSSP48449 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSSP48449 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSSP48449 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LSSP48449 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSSP48449 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSSP48449 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSSP48449 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LSSP48449 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSSP48449 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms