Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA8P48165 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA8P48165 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA8P48165 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA8P48165 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA8P48165 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA8P48165 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA8P48165 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA8P48165 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA8P48165 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA8P48165 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA8P48165 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA8P48165 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA8P48165 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA8P48165 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA8P48165 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA8P48165 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA8P48165 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA8P48165 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA8P48165 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA8P48165 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA8P48165 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA8P48165 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA8P48165 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA8P48165 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA8P48165 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA8P48165 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA8P48165 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA8P48165 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA8P48165 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA8P48165 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA8P48165 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA8P48165 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA8P48165 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA8P48165 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA8P48165 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA8P48165 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA8P48165 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA8P48165 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA8P48165 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA8P48165 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA8P48165 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA8P48165 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA8P48165 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA8P48165 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA8P48165 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA8P48165 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA8P48165 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA8P48165 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA8P48165 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA8P48165 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA8P48165 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GJA8P48165 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA8P48165 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA8P48165 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA8P48165 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA8P48165 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA8P48165 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA8P48165 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA8P48165 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA8P48165 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA8P48165 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA8P48165 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA8P48165 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA8P48165 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA8P48165 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA8P48165 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA8P48165 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA8P48165 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA8P48165 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA8P48165 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA8P48165 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA8P48165 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA8P48165 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA8P48165 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA8P48165 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA8P48165 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA8P48165 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA8P48165 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA8P48165 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA8P48165 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms