Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPL28P46779 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPL28P46779 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPL28P46779 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPL28P46779 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPL28P46779 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPL28P46779 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPL28P46779 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPL28P46779 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPL28P46779 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL28P46779 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL28P46779 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL28P46779 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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