Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATRXP46100 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATRXP46100 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRXP46100 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRXP46100 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRXP46100 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRXP46100 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRXP46100 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRXP46100 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRXP46100 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRXP46100 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRXP46100 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRXP46100 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRXP46100 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATRXP46100 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATRXP46100 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRXP46100 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRXP46100 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRXP46100 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRXP46100 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRXP46100 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms