Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL35P42766 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL35P42766 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL35P42766 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL35P42766 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL35P42766 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL35P42766 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL35P42766 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL35P42766 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL35P42766 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL35P42766 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL35P42766 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL35P42766 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL35P42766 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL35P42766 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL35P42766 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL35P42766 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL35P42766 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms