Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPOP42166 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPOP42166 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPOP42166 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPOP42166 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPOP42166 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPOP42166 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPOP42166 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPOP42166 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPOP42166 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPOP42166 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPOP42166 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPOP42166 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPOP42166 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPOP42166 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPOP42166 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPOP42166 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPOP42166 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMPOP42166 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMPOP42166 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMPOP42166 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMPOP42166 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMPOP42166 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMPOP42166 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMPOP42166 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMPOP42166 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMPOP42166 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMPOP42166 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMPOP42166 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMPOP42166 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMPOP42166 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TMPOP42166 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMPOP42166 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMPOP42166 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMPOP42166 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMPOP42166 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMPOP42166 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMPOP42166 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMPOP42166 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMPOP42166 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMPOP42166 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMPOP42166 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMPOP42166 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMPOP42166 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMPOP42166 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMPOP42166 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMPOP42166 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMPOP42166 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMPOP42166 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TMPOP42166 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMPOP42166 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMPOP42166 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMPOP42166 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMPOP42166 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMPOP42166 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMPOP42166 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMPOP42166 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMPOP42166 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMPOP42166 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMPOP42166 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMPOP42166 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMPOP42166 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMPOP42166 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMPOP42166 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMPOP42166 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMPOP42166 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMPOP42166 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMPOP42166 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMPOP42166 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMPOP42166 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMPOP42166 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMPOP42166 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMPOP42166 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPOP42166 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPOP42166 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPOP42166 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPOP42166 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPOP42166 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPOP42166 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPOP42166 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPOP42166 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPOP42166 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPOP42166 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms