Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPHP41219 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPHP41219 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPHP41219 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPHP41219 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPHP41219 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPHP41219 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPHP41219 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPHP41219 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPHP41219 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPHP41219 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPHP41219 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPHP41219 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPHP41219 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPHP41219 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPHP41219 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPHP41219 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPHP41219 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPHP41219 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPHP41219 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPHP41219 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPHP41219 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPHP41219 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPHP41219 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPHP41219 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPHP41219 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPHP41219 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPHP41219 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPHP41219 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPHP41219 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPHP41219 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPHP41219 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPHP41219 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPHP41219 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPHP41219 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPHP41219 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPHP41219 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPHP41219 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPHP41219 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPHP41219 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPHP41219 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPHP41219 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPHP41219 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPHP41219 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPHP41219 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPHP41219 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPHP41219 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPHP41219 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPHP41219 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPHP41219 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPHP41219 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPHP41219 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPHP41219 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPHP41219 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms