Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4AP40617 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4AP40617 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms