Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX1P40424 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX1P40424 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX1P40424 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX1P40424 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX1P40424 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX1P40424 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX1P40424 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX1P40424 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX1P40424 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX1P40424 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX1P40424 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX1P40424 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX1P40424 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX1P40424 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX1P40424 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX1P40424 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX1P40424 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PBX1P40424 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PBX1P40424 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PBX1P40424 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX1P40424 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX1P40424 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX1P40424 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX1P40424 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX1P40424 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX1P40424 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX1P40424 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX1P40424 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX1P40424 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX1P40424 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX1P40424 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX1P40424 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX1P40424 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX1P40424 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX1P40424 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX1P40424 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX1P40424 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX1P40424 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX1P40424 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX1P40424 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX1P40424 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX1P40424 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX1P40424 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX1P40424 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX1P40424 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX1P40424 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX1P40424 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX1P40424 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX1P40424 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX1P40424 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX1P40424 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX1P40424 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX1P40424 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX1P40424 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX1P40424 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX1P40424 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX1P40424 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX1P40424 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX1P40424 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX1P40424 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms