Protein–RNA interactions for Protein: P40227

CCT6A, T-complex protein 1 subunit zeta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT6AP40227 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCT6AP40227 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT6AP40227 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms