Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGCXP38435 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GGCXP38435 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GGCXP38435 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GGCXP38435 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GGCXP38435 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GGCXP38435 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GGCXP38435 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GGCXP38435 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGCXP38435 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGCXP38435 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGCXP38435 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGCXP38435 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGCXP38435 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGCXP38435 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGCXP38435 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGCXP38435 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GGCXP38435 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGCXP38435 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGCXP38435 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGCXP38435 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGCXP38435 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGCXP38435 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGCXP38435 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGCXP38435 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGCXP38435 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGCXP38435 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGCXP38435 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGCXP38435 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGCXP38435 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGCXP38435 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGCXP38435 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGCXP38435 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGCXP38435 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGCXP38435 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGCXP38435 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGCXP38435 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGCXP38435 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGCXP38435 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGCXP38435 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGCXP38435 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGCXP38435 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms