Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms