Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNNA1P35221 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA1P35221 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms