Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP2P32456 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP2P32456 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP2P32456 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP2P32456 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP2P32456 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP2P32456 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP2P32456 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP2P32456 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP2P32456 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP2P32456 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP2P32456 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP2P32456 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP2P32456 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP2P32456 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP2P32456 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP2P32456 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP2P32456 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP2P32456 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP2P32456 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP2P32456 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP2P32456 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP2P32456 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP2P32456 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP2P32456 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP2P32456 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP2P32456 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP2P32456 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP2P32456 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP2P32456 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP2P32456 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP2P32456 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP2P32456 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP2P32456 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP2P32456 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP2P32456 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP2P32456 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP2P32456 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP2P32456 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP2P32456 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP2P32456 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP2P32456 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP2P32456 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP2P32456 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP2P32456 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP2P32456 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP2P32456 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms