Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASQ1P31415 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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