Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPS1P31327 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPS1P31327 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CPS1P31327 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CPS1P31327 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CPS1P31327 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CPS1P31327 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CPS1P31327 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CPS1P31327 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CPS1P31327 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CPS1P31327 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CPS1P31327 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPS1P31327 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CPS1P31327 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPS1P31327 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPS1P31327 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPS1P31327 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPS1P31327 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPS1P31327 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPS1P31327 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPS1P31327 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPS1P31327 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPS1P31327 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPS1P31327 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPS1P31327 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPS1P31327 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CPS1P31327 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CPS1P31327 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CPS1P31327 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CPS1P31327 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CPS1P31327 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CPS1P31327 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CPS1P31327 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CPS1P31327 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CPS1P31327 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CPS1P31327 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CPS1P31327 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPS1P31327 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPS1P31327 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPS1P31327 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPS1P31327 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CPS1P31327 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPS1P31327 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPS1P31327 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPS1P31327 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPS1P31327 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPS1P31327 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPS1P31327 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPS1P31327 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CPS1P31327 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPS1P31327 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPS1P31327 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPS1P31327 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPS1P31327 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPS1P31327 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPS1P31327 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPS1P31327 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPS1P31327 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CPS1P31327 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPS1P31327 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPS1P31327 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPS1P31327 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPS1P31327 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPS1P31327 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPS1P31327 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPS1P31327 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPS1P31327 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPS1P31327 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPS1P31327 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPS1P31327 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPS1P31327 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPS1P31327 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPS1P31327 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPS1P31327 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPS1P31327 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPS1P31327 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPS1P31327 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPS1P31327 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPS1P31327 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPS1P31327 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPS1P31327 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPS1P31327 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPS1P31327 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CPS1P31327 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CPS1P31327 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CPS1P31327 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CPS1P31327 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CPS1P31327 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CPS1P31327 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPS1P31327 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPS1P31327 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPS1P31327 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPS1P31327 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPS1P31327 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CPS1P31327 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPS1P31327 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPS1P31327 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPS1P31327 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPS1P31327 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CPS1P31327 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms