Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRBP28702 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRBP28702 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRBP28702 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRBP28702 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRBP28702 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRBP28702 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRBP28702 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRBP28702 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRBP28702 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRBP28702 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRBP28702 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRBP28702 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRBP28702 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRBP28702 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRBP28702 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRBP28702 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RXRBP28702 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RXRBP28702 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRBP28702 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRBP28702 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRBP28702 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRBP28702 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRBP28702 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRBP28702 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRBP28702 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRBP28702 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRBP28702 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRBP28702 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRBP28702 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRBP28702 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRBP28702 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRBP28702 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRBP28702 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRBP28702 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRBP28702 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRBP28702 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRBP28702 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRBP28702 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRBP28702 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRBP28702 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRBP28702 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRBP28702 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRBP28702 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRBP28702 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRBP28702 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRBP28702 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRBP28702 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRBP28702 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRBP28702 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRBP28702 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRBP28702 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRBP28702 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRBP28702 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRBP28702 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRBP28702 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRBP28702 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRBP28702 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRBP28702 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRBP28702 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRBP28702 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRBP28702 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRBP28702 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRBP28702 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RXRBP28702 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RXRBP28702 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RXRBP28702 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RXRBP28702 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RXRBP28702 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RXRBP28702 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RXRBP28702 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RXRBP28702 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RXRBP28702 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRBP28702 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRBP28702 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRBP28702 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRBP28702 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRBP28702 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRBP28702 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRBP28702 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRBP28702 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRBP28702 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRBP28702 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRBP28702 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRBP28702 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRBP28702 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRBP28702 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRBP28702 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRBP28702 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRBP28702 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRBP28702 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRBP28702 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRBP28702 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRBP28702 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRBP28702 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRBP28702 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRBP28702 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRBP28702 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRBP28702 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRBP28702 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms