Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms