Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms