Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IL3RAP26951 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms