Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB2P26583 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms