Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms