Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRBP23467 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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