Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VDAC1P21796 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VDAC1P21796 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VDAC1P21796 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VDAC1P21796 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VDAC1P21796 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VDAC1P21796 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VDAC1P21796 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VDAC1P21796 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VDAC1P21796 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VDAC1P21796 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms