Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EPHA1P21709 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPHA1P21709 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms