Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIG1P18858 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIG1P18858 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIG1P18858 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIG1P18858 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIG1P18858 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG1P18858 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG1P18858 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG1P18858 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG1P18858 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG1P18858 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG1P18858 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG1P18858 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG1P18858 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG1P18858 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG1P18858 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG1P18858 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG1P18858 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG1P18858 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG1P18858 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG1P18858 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG1P18858 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG1P18858 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG1P18858 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG1P18858 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG1P18858 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG1P18858 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG1P18858 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG1P18858 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG1P18858 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG1P18858 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG1P18858 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG1P18858 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG1P18858 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG1P18858 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG1P18858 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG1P18858 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIG1P18858 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIG1P18858 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIG1P18858 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIG1P18858 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIG1P18858 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIG1P18858 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIG1P18858 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms