Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDE6GP18545 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PDE6GP18545 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PDE6GP18545 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PDE6GP18545 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PDE6GP18545 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PDE6GP18545 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PDE6GP18545 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PDE6GP18545 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PDE6GP18545 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PDE6GP18545 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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