Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME1P15531 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME1P15531 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME1P15531 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NME1P15531 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NME1P15531 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME1P15531 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME1P15531 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME1P15531 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME1P15531 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME1P15531 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME1P15531 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME1P15531 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME1P15531 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME1P15531 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME1P15531 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME1P15531 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME1P15531 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME1P15531 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NME1P15531 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME1P15531 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME1P15531 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME1P15531 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NME1P15531 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME1P15531 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME1P15531 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME1P15531 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NME1P15531 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NME1P15531 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NME1P15531 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NME1P15531 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NME1P15531 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms