Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAV1P15498 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAV1P15498 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAV1P15498 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAV1P15498 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAV1P15498 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAV1P15498 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAV1P15498 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAV1P15498 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAV1P15498 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAV1P15498 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAV1P15498 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAV1P15498 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAV1P15498 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAV1P15498 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAV1P15498 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAV1P15498 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VAV1P15498 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAV1P15498 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAV1P15498 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAV1P15498 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAV1P15498 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAV1P15498 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAV1P15498 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAV1P15498 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAV1P15498 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAV1P15498 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAV1P15498 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAV1P15498 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAV1P15498 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAV1P15498 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAV1P15498 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAV1P15498 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAV1P15498 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAV1P15498 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAV1P15498 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAV1P15498 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VAV1P15498 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAV1P15498 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAV1P15498 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAV1P15498 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAV1P15498 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VAV1P15498 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VAV1P15498 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAV1P15498 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAV1P15498 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAV1P15498 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VAV1P15498 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAV1P15498 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAV1P15498 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAV1P15498 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAV1P15498 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAV1P15498 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAV1P15498 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAV1P15498 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAV1P15498 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAV1P15498 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAV1P15498 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms