Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms