Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BMP3P12645 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BMP3P12645 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BMP3P12645 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BMP3P12645 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BMP3P12645 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BMP3P12645 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BMP3P12645 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BMP3P12645 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BMP3P12645 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BMP3P12645 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BMP3P12645 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BMP3P12645 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BMP3P12645 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BMP3P12645 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP3P12645 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP3P12645 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP3P12645 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP3P12645 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP3P12645 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP3P12645 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP3P12645 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP3P12645 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP3P12645 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP3P12645 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP3P12645 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP3P12645 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP3P12645 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP3P12645 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP3P12645 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP3P12645 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP3P12645 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP3P12645 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP3P12645 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP3P12645 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP3P12645 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP3P12645 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP3P12645 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP3P12645 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP3P12645 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP3P12645 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP3P12645 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP3P12645 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP3P12645 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP3P12645 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMP3P12645 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMP3P12645 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMP3P12645 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BMP3P12645 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMP3P12645 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMP3P12645 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMP3P12645 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMP3P12645 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMP3P12645 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMP3P12645 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMP3P12645 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BMP3P12645 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BMP3P12645 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BMP3P12645 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BMP3P12645 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BMP3P12645 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BMP3P12645 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BMP3P12645 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BMP3P12645 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BMP3P12645 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BMP3P12645 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BMP3P12645 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BMP3P12645 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms