Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ODC1P11926 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ODC1P11926 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODC1P11926 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ODC1P11926 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODC1P11926 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODC1P11926 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODC1P11926 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODC1P11926 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODC1P11926 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODC1P11926 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODC1P11926 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODC1P11926 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODC1P11926 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODC1P11926 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODC1P11926 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODC1P11926 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODC1P11926 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ODC1P11926 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODC1P11926 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODC1P11926 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODC1P11926 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODC1P11926 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODC1P11926 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODC1P11926 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODC1P11926 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODC1P11926 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODC1P11926 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODC1P11926 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODC1P11926 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODC1P11926 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODC1P11926 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODC1P11926 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODC1P11926 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODC1P11926 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODC1P11926 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODC1P11926 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODC1P11926 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODC1P11926 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODC1P11926 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODC1P11926 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODC1P11926 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms