Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MS4A1P11836 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms