Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1P11387 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1P11387 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1P11387 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP1P11387 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1P11387 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1P11387 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1P11387 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1P11387 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1P11387 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1P11387 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1P11387 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1P11387 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1P11387 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1P11387 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1P11387 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP1P11387 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP1P11387 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1P11387 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1P11387 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1P11387 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1P11387 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1P11387 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1P11387 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1P11387 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1P11387 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1P11387 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1P11387 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1P11387 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1P11387 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1P11387 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1P11387 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP1P11387 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP1P11387 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOP1P11387 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP1P11387 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP1P11387 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP1P11387 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP1P11387 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP1P11387 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP1P11387 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP1P11387 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP1P11387 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP1P11387 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP1P11387 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1P11387 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1P11387 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1P11387 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1P11387 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1P11387 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1P11387 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1P11387 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1P11387 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1P11387 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1P11387 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1P11387 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP1P11387 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1P11387 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1P11387 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP1P11387 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms