Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRFP10586 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms