Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APELAP0DMC3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms