Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms