Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms