Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSF1RP07333 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms