Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPIND1P05546 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERPIND1P05546 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms