Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLEC3BP05452 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms