Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB2P05107 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGB2P05107 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms