Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGAP02671 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGAP02671 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGAP02671 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGAP02671 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGAP02671 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGAP02671 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGAP02671 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGAP02671 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGAP02671 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGAP02671 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FGAP02671 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGAP02671 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGAP02671 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGAP02671 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGAP02671 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGAP02671 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGAP02671 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGAP02671 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGAP02671 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGAP02671 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGAP02671 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGAP02671 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGAP02671 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FGAP02671 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGAP02671 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGAP02671 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGAP02671 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGAP02671 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGAP02671 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGAP02671 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FGAP02671 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FGAP02671 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FGAP02671 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGAP02671 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGAP02671 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FGAP02671 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGAP02671 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FGAP02671 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGAP02671 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGAP02671 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGAP02671 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGAP02671 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGAP02671 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGAP02671 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGAP02671 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGAP02671 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGAP02671 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGAP02671 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGAP02671 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGAP02671 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGAP02671 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGAP02671 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGAP02671 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGAP02671 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGAP02671 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGAP02671 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGAP02671 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGAP02671 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGAP02671 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGAP02671 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGAP02671 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGAP02671 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FGAP02671 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGAP02671 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGAP02671 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms