Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1O95476 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms