Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG12O94817 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG12O94817 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG12O94817 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG12O94817 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG12O94817 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG12O94817 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG12O94817 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG12O94817 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG12O94817 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG12O94817 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG12O94817 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG12O94817 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG12O94817 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG12O94817 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG12O94817 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG12O94817 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG12O94817 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG12O94817 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG12O94817 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG12O94817 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG12O94817 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG12O94817 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG12O94817 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG12O94817 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG12O94817 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG12O94817 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG12O94817 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG12O94817 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG12O94817 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG12O94817 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG12O94817 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG12O94817 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG12O94817 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG12O94817 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms