Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM2O94769 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM2O94769 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM2O94769 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM2O94769 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM2O94769 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM2O94769 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM2O94769 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM2O94769 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM2O94769 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM2O94769 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM2O94769 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM2O94769 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM2O94769 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM2O94769 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM2O94769 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM2O94769 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM2O94769 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM2O94769 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM2O94769 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM2O94769 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM2O94769 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM2O94769 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM2O94769 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM2O94769 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM2O94769 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM2O94769 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM2O94769 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM2O94769 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM2O94769 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM2O94769 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM2O94769 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM2O94769 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM2O94769 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM2O94769 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM2O94769 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM2O94769 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM2O94769 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM2O94769 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM2O94769 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM2O94769 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM2O94769 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM2O94769 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM2O94769 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM2O94769 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM2O94769 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM2O94769 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM2O94769 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM2O94769 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM2O94769 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM2O94769 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM2O94769 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM2O94769 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM2O94769 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM2O94769 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM2O94769 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM2O94769 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM2O94769 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM2O94769 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ECM2O94769 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM2O94769 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM2O94769 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM2O94769 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM2O94769 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM2O94769 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM2O94769 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM2O94769 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM2O94769 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM2O94769 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM2O94769 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM2O94769 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM2O94769 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM2O94769 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM2O94769 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM2O94769 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM2O94769 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms